Да, может! Это одно из основных нововведений.

Режим Safe Mod ограничивает возможности PHP по выполнению операций с каталогами и файлами, не принадлежащими тому пользователю, от имени которого запущен сам PHP (обычно, этот пользователь - "apache"). Для нормальной работы с каталогами и файлами в Joomla! 1.5 введена возможность доступа через FTP. Именно комбинация обычных файловых операций PHP и доступ по FTP позволяют Joomla! работать на серверах с включенным Safe Mode.